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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

中国民航局：已开始受理中美航空公司恢复运营中美航线的申请******

　　中新社北京1月10日电 (记者 黄钰钦 李纯)针对中美直航班次恢复计划，中国民航局运输司司长、一级巡视员梁楠10日在北京表示，民航局1月8日起已开始受理中外航空公司复航申请，其中包括中美航空公司恢复运营中美航线的申请。

　　当日，中共中央对外联络部邀请在华外国工商界人士出席中国防疫政策专题吹风会。谈及外界关注的中美直航班次恢复进展，梁楠在会上表示，中方1月8日起对新型冠状病毒感染实施“乙类乙管”，相关措施包括取消客座率限制等国际客运航班数量管控措施。包括美方航空公司在内的中外航空公司，可以按照双边航空运输协定安排运营定期客运航班。

　　梁楠指出，民航局正在按照程序抓紧做好审批工作，欢迎中美航空公司依照协定和市场需求运营两国间航班，为促进两国人员往来和经贸交往作出新的更大贡献。在航班恢复过程中，民航局也会加强与美国民航主管部门沟通，推进中美之间航班顺利复航。

　　梁楠介绍称，民航局自1月8日起已经开始受理中外航空公司航班计划申请，已经有近40家中外航空公司报送了涉及34个国家、每周约700班客运航班计划申请，其中大部分航班计划于1月下旬至2月期间恢复运营，民航局正在按照程序抓紧审核办理。同时，民航局已经恢复受理国际客运包机、公务机申请，满足国际公商务往来需求。

　　在国际客运航空市场恢复预期方面，梁楠表示，考虑到航空公司恢复运营，国际航班受到市场需求、运力安排、时刻协调、中外航空当局批复等多重因素影响，需要较长准备时间。另一方面，历经三年的疫情冲击，旅客跨国出行意愿仍需一段时间逐步恢复。总体来看，国际航空市场的恢复进度将慢于国内航空市场。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）